在职人员如果单位不允许的话是不是就不能报考少数民族骨干研究生？

理论上讲，如果是单位在职人员要报考定向研究生必须得到单位同意。据我所知，用少数民族骨干计划报考时需填写一个申请表格，如果是在职人员就必须在表格上有单位同意的盖章。没有盖章地方教育厅是不会让你以在职人员身份报考少数民族骨干计划的。
如果你执意报考，单位又不同意你考，也不给你盖章，那么你可以用往届非在职的身份报考，考上研究生后辞职不干。同时你也失去了公务员的编制。
我建议你可以用“各种方法”讨好你的领导，让他同意。至于各种方法的真谛你应该明白吧。
另外，今年的少数民族骨干计划是要收学费的，如果你以“在职”身份考取，单位会为你负担一部分。如果你以往届非在职身份报考，就只能自负了。但是各大高校会对少数民族骨干计划的学生有一定的补助，补助政策各校不一，建议你打电话向目标高校研招办咨询详情。
还有疑问可以追问。