辞职去读研了，工作期间缴纳的各种保险和住房公积金会被清零吗？

只有医保的缴费年限要清0，但医保卡上的钱是用完为止，养老保险是可累计缴费年限，公积金要是在户口所在地是要两年才能提取，不是你的户口所在地的是可离职后提的，都是凭离职手续。
你要是今后准备考公务员或事业单位，建议你的养老继续交，考上不缴养老保险的单位后，你以前的社保缴费年限是算你的工龄，是以社保记录为依据的

离职-社保：
从单位离职，个人持身份证、离职证明等资料去社保局申请，以个人名义续缴保险，可购置2险(养老、医疗)，累积缴纳年限即可。入职新单位，个人办理停保，新单位办理入保；本人为外地户口，可以办理转出手续，需在原单位社保中心开具参保缴费凭证，带到你老家的社保机构办理转入手续。

离职-公积金：
如果你个人暂时没有其他需要，可以先不管，再次入职，进行公积金转移手续（这由企业人员办理，你个人只需要联系新单位的传递“接收函”给原单位就可以了）。

辞职去读研期间，可以申请暂停缴纳，再就业后，续缴社保、公积金即可，并不影响你的累计缴费年限。

自己继续交就不会被清零，反之，如果不交除了养老，其他的都是0

公积金可以取现的，社保不会清零，是累计的

首先，恭喜楼主，可以读研（我也有这样的想法，就是工作忙，一直没有机会）。
如果您是农业户口，可以提供户口本等证件，给单位的人事部门经办人，要求提取公积金和清算保险。
当然，最好的选择是这些保险暂时先不用管它，等你读书结束后，还得工作吧。到时候又会参加保险，即使不是一个城市，现在全国保险可以相互转移，您到新的公司上班参保后，提供账户名单给原单位人事保险和公积金经办人，要求转移保险和住房公积金。
总之，即使您以后不上公积金，只要买房或者发生相关费用的发票等证件给原单位经办人，就可以支取公积金。一直不买房的可以退休时候领取。
保险最终交到退休，可以在户籍所在地领取养老金。