在职研究生今后如果打算继续深造或出国，门槛会不会有限制

其实问题并不大，考博一般也没有制度性障碍（但是导师是否有偏见就很难说了），国内的研究生对外国的研究生一般没有影响，出过一定是读博士，而国外一般本科生就可以直接考博（比如美国），所以要出国还是要看你的寄托成绩，在校就读表现（GPA、科研论文情况等）以及推荐信等等。